Birštono sakralinio muziejaus įsteigimo idėja kilo Birštono parapijos klebonui mons. J. Dalinevičiui 1999 m. Birštono savivaldybės meras A. S. Zenkevičius pritarė idėjai, o gavus palaiminimą iš Kardinolo Vincento Sladkevičiaus, mintis įkurti muziejų buvo realizuota. 2000 m. gruodžio 26 d. švenčiant Krikščionybės jubiliejinius metus Birštono sakralinis muziejus buvo atvertas lankytojams. Eksponatus muziejui rinko klebonas mons. J. Dalinevičius drauge su Birštono muziejaus direktoriumi V. Puskunigiu, vyr. fondų saugotoju J. Šleikumi, muziejininke R. Zajančkauskiene. Buvo kreiptasi į V. Sladkevičiaus giminaitę J. Lukavičienę, vysk. T. Matulionio gimines – kun. J. Pilką, jo brolį T. Pilką. Kaišiadorių vyskupas emeritas Juozas Matulaitis deponavo Kaišiadorių vyskupijos bažnytinio paveldo reliktų, kurie liturgijoje nenaudojami, o muziejaus lankytojams sukelia grožio ir harmonijos pajutimą.

